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nicolas-zimmermann hace 5 años
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wgs.sh Ver fichero

@@ -37,3 +37,5 @@ sed "s:>:*\n>:g" results/genes.fna | sed -n "/partial=00/,/*/p"|grep -v "*" > re
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 # Question 6
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 blastn -query results/genes_full.fna -db databases/resfinder.fna -perc_identity 0.8 -qcov_hsp_perc 0.8 -evalue 1e-3 -outfmt 6 -out results/annoted_genes.dat
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+
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+# Les génomes présentent de nombreux gènes de résistances à des antibiotiques : catB7, floR, tet(A)....