浏览代码

added final response

nicolas-zimmermann 5 年前
父节点
当前提交
e84c90c9b6
共有 1 个文件被更改,包括 2 次插入0 次删除
  1. 2 0
      wgs.sh

+ 2 - 0
wgs.sh 查看文件

@@ -37,3 +37,5 @@ sed "s:>:*\n>:g" results/genes.fna | sed -n "/partial=00/,/*/p"|grep -v "*" > re
37 37
 # Question 6
38 38
 
39 39
 blastn -query results/genes_full.fna -db databases/resfinder.fna -perc_identity 0.8 -qcov_hsp_perc 0.8 -evalue 1e-3 -outfmt 6 -out results/annoted_genes.dat
40
+
41
+# Les génomes présentent de nombreux gènes de résistances à des antibiotiques : catB7, floR, tet(A)....