53 Commits (master)
 

Autor SHA1 Mensaje Fecha
  tforest 1848102140 Fixing some scaling for swp2 output hace 8 meses
  tforest 25d7ef0858 Improving sfs plotting hace 8 meses
  tforest 14538a747b Add some outputs for swp2 parsing hace 8 meses
  tforest 7949befb40 Adjust xlim and ylims for swp2 hace 9 meses
  tforest 658693c2a2 Fixing some plotting issues for swp2 hace 9 meses
  tforest 541d1d7348 Fixing the sorting of best scenarios for swp2 parsing hace 9 meses
  tforest 0ffb02e511 Some tweaking of axis limits hace 9 meses
  tforest 03ea6f938b Improve plotting with concordant colours hace 9 meses
  tforest 4aedf5e280 Improve plotting with swp2 control curve hace 9 meses
  tforest 8c8545a9ff Previous plotting system before feb version hace 9 meses
  tforest 44449033db Update SFS plotting function hace 9 meses
  tforest fed1a36d79 Get rid of the old plot_all_epochs_theta hace 11 meses
  tforest f90938f8d9 Save all epochs in JSON hace 11 meses
  tforest 6a6d4bf6f9 Remove unused functions for swp2 hace 11 meses
  tforest 89813468b5 First version of the new layout of combined plots hace 11 meses
  tforest eb2799bc98 Fixing proportion labels hace 11 meses
  tforest 66d399d6f0 Keeping only thetas with the lowest logLik for breakpoints thetas hace 11 meses
  tforest 6287f2aa71 Fixing plot font size issues hace 11 meses
  tforest 2e4aca9951 Update on swp2 plots hace 11 meses
  tforest 3f174048f1 Grid of plots for swp2 thetas hace 11 meses
  tforest 43f689e764 Some progress on subplots hace 11 meses
  tforest 46a2990a2d Adjust x-axis ticks for large SFSs hace 11 meses
  tforest 87bef76e28 Compute proportion of information used for theta plots hace 11 meses
  tforest 23fef174f2 Ok likelihood swp2 hace 11 meses
  tforest 2253ce5f67 theoritical logLn swp2 hace 11 meses
  tforest 463b9e63f9 New plots for swp2 output files hace 1 año
  tforest f79d48bf5b Rectify swp2 plot hace 1 año
  tforest bbc06411e9 swp2 plotting improve hace 1 año
  tforest ecc6fd23fc sfs plotting hace 1 año
  tforest 592b16e7f3 Swp2 plot but reversed hace 1 año
  tforest 20d66bf1cc Modify the sfs plot hace 1 año
  tforest 2b5dc75f30 swp2 plot add hace 1 año
  tforest f3fc152df3 correction of transformed sfs plot hace 1 año
  tforest a92dba2d25 correction for sfs transform plot hace 2 años
  tforest a8b5c1aa6f update the sfs_barplot auto title hace 2 años
  tforest ec972a7cdf update sfs plot and vcf parsing hace 2 años
  tforest 856e20d46e improve gestion of already parsed vcf for other functions hace 2 años
  tforest a7e78958b2 update output plotting of chrom continuity hace 2 años
  tforest 8d4d36a1f9 better gestion of memory while parsing vcf hace 2 años
  tforest a439f0cef6 add stats sfs hace 2 años
  tforest 0425fcfa03 fix karyotype plot hace 2 años
  tforest 017bf2c4ed corr. vcf_to_sfs hace 2 años
  tforest 257c713458 update plot lib form multiple chrom coverage hace 2 años
  tforest 7a08bb7b41 add scripts for vcf tools hace 2 años
  tforest 91915e5fa8 Modifs script C hace 3 años
  tforest 86f84a676d Add C version start hace 3 años
  tforest 6799dd9a53 Cleaned hace 3 años
  tforest 77991f07ad Before clean comments hace 3 años
  tforest c1e2cc9192 add polyallelic snps hace 3 años
  tforest 110ba26f7e add comments hace 3 años